Staffel 2

Dan liegt nach seinem Herzinfarkt komatös im Krankenhaus. Nachdem Keith und Lucas – die erst kurz zuvor in ihrer neuen Wohnung angekommen sind – davon erfahren, beschließen sie, nach Tree Hill zurückzukehren, um ihrer Familie beizustehen.

Dan ist aus seinem Koma erwacht und versucht nun redlich, ein besserer Mensch zu sein, als er es vor seinem Herzinfarkt war. Er will sein Verhältnis zu seinen beiden Söhnen verbessern, und vergibt Keith und Deb, das sie miteinander geschlafen haben

Da Nathan vor seiner Hochzeit keinen Junggesellenabschied hatte, beschließt sein Kumpel Tim diesen nachzuholen. Der Abend verläuft allerdings nicht ganz wie geplant. Unterdessen veranstaltet Brooke einen Junggesellinnenabschied für Haley

Booke hat einen neuen Nachbarn: Den etwas arroganten Felix, der auch in der Schule schnell auf sich aufmerksam macht. Nathan und Haley haben einen Streit, da Nathan Geld, das die beiden für ein Auto gespart haben, für ein Keyboard ausgegeben hat, um Haley eine Freude zu machen. Obwohl sie sich über das Instrument freut, findet sie sein Verhalten verantwortungslos, da die beiden nicht sehr viel Geld haben

Felix organisiert ein Spiel, bei dem die Teilnehmer einige Herausforderungen und Mutproben bestehen müssen, und lädt dazu einige seiner Mitschüler ein. Er arrangiert es so, dass er mit Brooke in einem Team ist, um Zeit mit ihr verbringen zu können.

Peyton – die von Karen gebeten wurde ihren neuen Klub zu managen – sucht für dessen Eröffnungsnacht noch Musiker. Fündig wird sie schließlich in Haley und dem, sehr von sich selbst überzeugten, Chris Keller.

Karens Klub – das TRIC – hat seine Eröffnungsnacht. Haley, die dort als Sängerin auftreten soll, hat starkes Lampenfieber und will schon einen Rückzieher machen, als Chris Keller, der andere Musiker des Abends, Starallüren vorgibt und sich weigert aufzutreten.

Lucas und Nathan fahren nach Charlotte, um sich ein Spiel der Charlotte Bobcats anzusehen. Nach dem Spiel überrascht Nathan Luke mit dem Geständnis, dass er für sie beide für den folgenden Tag einen Termin bei einem Charlestoner Kardiologen gemacht hat

An der Tree Hill Highschool findet ein Schulball statt. Nathan hat dazu einen romantischen Abend geplant, wird aber von Haley enttäuscht, die sich verspätet. Sie hat zuvor zusammen mit Chris Keller für einen bevorstehenden Auftritt im TRIC geprobt.

Nach einem großen Streit verspricht Haley Nathan, keine Zeit mehr mit Chris Keller zu verbringen. Später teilt dieser ihr aber mit, dass er die Chance bekommen hat, bei einem Musikagenten in New York vorzuspielen und will sie überreden, mit ihm zu kommen. Dan bietet Keith eine Stelle als sein Stellvertreter in seiner Autohandlung an.

Haley entscheidet sich, doch nicht mit Chris Keller nach New York zu fahren und kehrt zu Nathan zurück. Zuhause angekommen, stellt sie fest, dass ihre Schwester Taylor überraschend zu Besuch gekommen ist. Nathan fühlt sich in Taylors Umgebung zunächst etwas nervös, weil sie die erste Frau war, mit der er geschlafen hat.

Keith schafft es, Luke zu überzeugen den Herz-Test zu machen zu lassen. Brooke nimmt einen Ferienjob an, ist aber mit den schlechten Arbeitsbedingungen unzufrieden. Luke konfrontiert Dan damit, dass er wisse, dass Dan Jules angeheuert habe. Dan erklärt ihm seine Motive und versichert ihm, dass er Jules inzwischen aus dem Vertrag entlassen habe.

Brooke beginnt den Wahlkampf für das Amt des Schulsprechers und trifft auf ihre Konkurrentin für das Amt – die bisherige Schulsprecherin Erica Marsh. Jake Jagielski kehrt nach Tree Hill zurück, sehr zur Freude all seiner Freunde. Luke erhält das Resultat seiner Herz-Untersuchung

Nathan ist mies gelaunt und traurig, weil Haley ihn verlassen hat und fällt durch sein schlechtes Verhalten auf. Karen ist wütend auf Luke, weil dieser nun bei Dan lebt. Da sie überzeugt ist, Dan erpresse Luke mit irgendwas, beschließt Andy gegen Dan vorzugehen.

Die Schüler an der Tree Hill High nehem Videobotschaften auf, die in einer Zeitkapsel 50 Jahre verschlossen werden sollen. Darin erzählen sie von ihrem Alltag und Dingen, die sie momentan beschäftigen. So redet Peyton beispielsweise von ihrem bevorstehenden ersten offiziellen Date mit Jake, und dass sie deswegen nervös ist.

Karen und Andi wollen Luke zurückgewinnen, und heuern daher einen Privatdetektiv an, der herausfinden soll, ob Dan Leichen im Keller hat. Von diesem erfahren die beiden, dass Dan Jules' Miete bezahlt, und dass ihr Name tatsächlich Emily Chambers ist. Da schon in kürze die Hochzeit von Jules und Keith ist, ist sich Karen nicht sicher, was sie machen soll.

Keith erfährt, dass Jules von Dan angeheuert wurde, um ihm das Herz zu brechen, woraufhin er diesen attackiert und Rache androht. Anschließend verlässt er Tree Hill, da ihn nun nichts mehr in der Stadt hält. Auch Brooke droht der Wegzug aus Tree Hill, da ihr Vater eine neue Arbeit in einer anderen Stadt gefunden hat. Verzweifelt versucht sie ihre Eltern zu überreden, sie bei Peyton wohnen zu lassen.

Jake erfährt, dass er ins Gefängnis muss, sollte er Jenny nicht Nicki überlassen. Coach Whitey will Jake daher überzeugen, Jenny aufzugeben, aber nachdem Jake ihm erklärt hat, dass Nicki als Mutter absolut ungeeignet ist, erklärt er sich bereit Jenny zu Verwandten nach Florida zu bringen. Jake stellt sich unterdessen der Polizei und wird verhaftet.

Nathans Onkel Cooper, ein professioneller Rennfahrer, möchte Nathan aufmuntern. Er lädt ihn und Luke ein, ihn ein paar Tage an der Rennstrecke zu besuchen. Unterdessen verliert Andy seine Dozenten-Stelle, da Dan bekannt gemacht hat, dass Andy in einer Beziehung mit Karen ist, eine seiner Studenten.

Nach seinem Unfall liegt Nathan im Koma. Er träumt, wie sein Leben verlaufen wäre, wenn Dan sich damals für Karen entschieden hätte, und nicht für Deb. In dem Traum ist Lucas der erfolgreiche Star des Tree-Hill-High-Basketballteams, während Nathan an der Schule ein Niemand ist. Sowohl Nathan als auch Lucas konkurrieren um einen Platz in einem renommierten Basketball-Sommer-Camp.

Nathan wird aus dem Krankenhaus entlassen, hat aber nun Probleme, die Rechnung zu bezahlen. Um ihm unter die Arme zu greifen, organisieren seine Freunde eine Filmnacht im TRIC, deren Erlös ihm zugutekommt. Überrascht stellt Nathan allerdings fest, dass seine Krankenhausrechnung bereits bezahlt wurde. Wie er später herausfindet, von Dan.

Lucas und Brooke fahren nach New York, um Haley zu besuchen. Luke will sie überreden, wieder nach Hause zurückzukehren. Andy muss aus familiären Gründen in seine Heimat Neuseeland zurückkehren, in dem Wissen, dass er nicht ohne weiteres in die USA zurückkehren kann, da Dan Beziehungen hat spielen lassen. Er und Karen machen daher Schluss.

Peyton wird von einer Frau namens Ellie Harp kontaktiert, die angeblich ein Interview mit ihr machen will, über die Konzerte mit namhaften Künstlern die sie schon organisiert hat. Peyton findet jedoch schnell heraus, dass das eine Lüge war. Damit konfrontiert gesteht Ellie ihr, sie sei ihre leibliche Mutter.